Os Serviços Administrativos da Irmandade da Santa Casa da Misericórdia estão instalados no edifício do Infantário. O organograma contempla três Escriturários e um Director de Serviços que exerce em simultâneo a função de Contabilista Certificado.
Este departamento é o centro nevrálgico da Instituição, sendo responsável pela contabilidade e organização documental das operações contabilísticas, pelo pagamento aos fornecedores e demais organismos, pelo processamento e pagamento dos salários, pelo envio e arquivamento da correspondência, pelos recursos humanos, pela aquisição dos consumíveis e pela gestão de utentes e associados. Presta assessoria aos Órgãos Sociais nas reuniões da Mesa Administrativa, bem como redige as actas da Mesa da Assembleia Geral.